La ubicación del Archivo ha estado unida a las distintas sedes que ha ocupado la Institución, encontrándose actualmente en la planta baja del edificio del Cabildo. Cuenta con dos espacios bastante amplios como depósitos de documentación, equipados con armarios compactos, medidores de temperatura y humedad y extractores de humedad.
El Archivo custodia diversos fondos:
- Fondo propio de la institución cabildicia
- Fondo Notarial
- Fondo de la Demarcación de Lanzarote del Colegio de Arquitectos de Canarias
- Fondo del Consejo Insular de Aguas de Lanzarote
- Fondo del Consorcio Insular del Agua de Lanzarote
- Fondo del Instituto Insular de Atención Social de Lanzarote
- Fondo personal Eugenio Rijo Rocha

De entre la documentación derivada de las competencias y funciones del Cabildo de Lanzarote podemos destacar la de la función de Gobierno, donde se agrupan series documentales correspondientes a los órganos de gobierno, que han permanecido vigentes a largo del tiempo, con un verdadero valor funcional, ya que personifican cada uno en sus respectivos ámbitos de actividad las principales competencias directivas de la corporación insular, nos referimos a los órganos unipersonales de gobierno: al Pleno, las comisiones, etc.: Expedientes de constitución de los Órganos, Actas del Pleno, Comisiones de Gobierno Insular, Comisiones de pleno, entre otras.
Bajo la función de Administración se agrupa la documentación resultante del ejercicio de competencias relativas a la administración interna de medios (bienes, recursos humanos, técnicos, administrativos y económico-financieros), encontramos series relacionadas con la normativa, reglamentos, convenios, inventarios, expedientes de procedimientos civiles, laborales, penales, etcétera.
Merece destacar también las características de la administración económico-financiera, es decir, la documentación generada en virtud del régimen presupuestario y contable, como las series documentales sobre formación de presupuestos, ejecución presupuestaria, los diferentes tipos de cuenta y libros de contabilidad; la documentación relativa a la obtención de recursos financieros no tributario viene siendo competencia de la intervención y fiscalización. La Tesorería que está destinada a las series documentales que son consecuencia de custodia y maneje de caudales públicos como las Cuentas de caudales y de Tesorería, Actas de arqueo, Contratos de apertura de cuentas y otros depósitos, etcétera.
Paralelamente a la administración interna de bienes se encuentra la administración externa de fines, es decir, la finalista, que se corresponde con los denominados Servicios, aquí se engloban las series que reflejan las funciones inherentes a la gestión de los servicios, prestados por las instituciones insulares a la ciudadanía y a las entidades del territorio insular en los distintos ámbitos de la vida pública, destacamos:
- Asesoramiento y asistencia a los municipios, especialmente a los de menos de 20.000 habitantes, y con atención preferente a los municipios con insuficiente capacidad económica y de gestión, así como al establecimiento y adecuada prestación de los servicios mínimos. Asistencia jurídica, técnica y administrativa (arts. 10,11,12,13 de la Ley 8/2015, de 1 de abril, de Cabildos Insulares).
- Beneficencia, Sanidad y Asistencia Social, es la producción documental derivada de la gestión directa en materia benéfico-asistencial y sanitaria.
- Obras Públicas y Política Territorial, encontramos la documentación que hace referencia a los planes insulares, al diseño y planificación de conjuntos de obras, se incluye, asimismo, las series documentales de obras de construcción, conservación e instalación en edificios insulares y municipales.
- Promoción Económica, recoge la variada representación documental de funciones desempeñadas por el Cabildo en relación con el fomento de los distintos sectores productivos integrantes de la economía insular: industria, comercio, turismo, etcétera.
Además del fondo documental emanado del desarrollo de las competencias del Cabildo, ya descrito, brevemente, el Archivo General Insular custodia otros fondo como el fondo Notarial, constituido por protocolos de los diferentes notarios que ejercieron en la isla de Lanzarote, cuando había una única notaría. En ellos se recogen los instrumentos públicos, es decir, los autorizados por el notario: las escrituras, cuyo contenido son las declaraciones de voluntad, los actos jurídicos que impliquen prestación de consentimiento y los contratos de todas clases. Las pólizas intervenidas, su contenido exclusivo son los actos y contratos de carácter mercantil y financiero que sean propios del tráfico habitual y ordinarios de sus otorgantes. Las Actas, que pueden ser de presencia (remisión de documentos por correo, notificaciones y requerimiento, etc.) de referencia, de notoriedad, de protocolización, etc. Los testimonios y legitimaciones de diverso tipo, las legalizaciones y las certificaciones de autenticidad de firmas o traducciones, en las cuales la función del notario se limita a ser simple intervención de fedación certificante. El protocolo más antiguo que poseemos es de 1851.
El fondo documental de la Demarcación de Lanzarote del Colegio de Arquitectos de Canarias, creada en el año 1991, y en 2017 pasó a denominarse Colegio Oficial de Arquitectos de Lanzarote; es una corporación de derecho público, integrada por los arquitectos a él incorporados, con personalidad jurídica propia y plena capacidad para el cumplimiento de sus fines.
Este fondo está conformado por documentación de carácter técnico, como los proyectos de edificación, de planeamiento, libros de órdenes y asistencias, certificaciones finales y otros, de los año 1970 a 1999. Está previsto que en breve transfieran documentación de los siguientes años. Su documentación puede consultarse previa solicitud de autorización al Colegio de Arquitectos de Lanzarote.
El fondo del Consejo Insular de Aguas de Lanzarote, constituido por la documentación generada desde su creación en 1990. El Consejo Insular de Aguas es una entidad de Derecho Público con personalidad jurídica propia y plena autonomía funcional, que asume en régimen de descentralización y participación, la dirección, ordenación, planificación y gestión unitaria de las aguas de la isla de Lanzarote.
En el Consejo Insular de Aguas de Lanzarote existe una amplia representación social, en la que participan el Gobierno de Canarias, Cabildo y ayuntamientos de la isla, consorcios, empresas públicas y de gestión de servicios públicos que operan en la isla y cuyas actividades estén directamente relacionadas con el agua, entidades concesionarias o titulares de aprovechamientos, así como de sus respectivas organizaciones, organizaciones agrarias, empresariales, sindicales y de consumidores y usuarios.
Entre su documentación encontramos la generada por sus órganos de gobierno, la que se deriva de los convenios con la Comunidad Autónoma, Cabildo y corporaciones locales, la relacionadas con el otorgamiento de concesiones, autorizaciones, certificaciones, la derivada de la participación en la preparación de los planes de ordenación territorial, económicos y demás que puedan estar relacionadas con las aguas de la isla, entre otras.
El fondo del Consorcio Insular del Agua de Lanzarote, es una Entidad Pública Local, creada en 1974, con participación exclusiva del Cabildo y los siete ayuntamientos de la isla, para la producción, distribución y depuración de aguas, siendo en ese momento INALSA su empresa instrumental, actualmente esa función la ejerce Canal Gestión Lanzarote.
Con la creación del Consorcio, la administración se hace con el control del uso del agua y las comunidades de regantes, existentes en ese momento, entran en crisis y terminan extinguiéndose, porque no podían competir con los precios de los organismos públicos y porque la disponibilidad de agua era mayor.
El fondo del Instituto Insular de Atención Social de Lanzarote, (en adelante IIASL), es un Organismo Autónomo de carácter administrativo adscrito a la Consejería de Empleo, Asuntos Sociales e Inmigración del Cabildo Insular de Lanzarote. Fue creado en el año 2003 y sus estatutos fueron publicados en el Boletín Oficial de la Provincia de Las Palmas Número 151, de fecha 17 de diciembre de 2003.
El artículo tercero de los mencionados estatutos recoge que el IIASL tiene entre sus fines esenciales la prestación de aquellos servicios sociales y sociosanitarios especializados competencia del Cabildo Insular de Lanzarote que, por la complejidad de la acción a desarrollar o por la especial situación del sujeto, requieren centros tecnificados o con capacidad de residencia temporal o permanente para los usuarios.
Asimismo, con su creación se asumía la gestión directa de los Centros de Menores Extranjeros No Acompañados existentes en la isla, que llegaban a las islas como consecuencia del fenómeno migratorio del momento, además de los recursos alojativos para mujeres víctimas de violencia de género, así como el Servicio de Inspección de la Red de Centros de Menores.
El IIASL dejó de estar operativo en 2019.
Fondo privado del letrado e investigador don Eugenio Rijo Rocha, integrado por documentos de diferente naturaleza, unos recopilados y otros generados por él a lo largo de su trayectoria profesional y fruto de su quehacer como investigador. Este legado documental es de gran importancia e interés para la interpretación de la historia de Lanzarote, dando garantías de veracidad de los hechos acontecidos en la isla recogidos en la documentación producida y recopilada por el autor. La totalidad del fondo está digitalizado.